More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1490 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
336 aa  681    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.96 
 
 
336 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 
331 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
339 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
339 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
335 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
350 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
338 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.07 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  35.98 
 
 
327 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
342 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
333 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
326 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
317 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
328 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
321 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
317 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
315 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 
329 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
310 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.51 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  28.29 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
694 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.21 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  26.91 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  33.5 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.3 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  26.75 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.75 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
680 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.22 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  20.99 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  27.3 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  26.36 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.87 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.37 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  26.21 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.53 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  28.69 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
408 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.25 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1439  epimerase/dehydratase, putative  24.32 
 
 
329 aa  62.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
333 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  29.05 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.4 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>