More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0710 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 339 aa  704    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.4 
 
 		 335 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.55 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.17 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.09 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.73 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  45.23 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.3 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.34 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.43 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.02 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  26.25 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.25 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  23.4 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.03 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.43 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  27.49 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.88 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  23.04 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  24.48 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.72 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.25 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.82 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.42 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  26.54 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  26.61 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  32.04 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  32.04 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  23.87 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  26.57 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.58 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  22.01 
 
 		 746 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  24.9 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  23.33 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  34.95 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  31.07 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  31.07 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  26.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  26.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.38 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  30.1 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.74 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  30.1 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.85 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.88 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  28.3 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  27.04 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000177562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>