More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2106 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
336 aa  677    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.96 
 
 
336 aa  431  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
331 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 
333 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
339 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
350 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
327 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
338 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
339 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  36.27 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.55 
 
 
329 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.98 
 
 
342 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
335 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
317 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
317 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
309 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
315 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.04 
 
 
313 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
309 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
311 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
321 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.24 
 
 
313 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
336 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
368 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
321 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  28.89 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  32.04 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.7 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  23.84 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  22.36 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  24.58 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.74 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  24.23 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  23.08 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.56 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  23.91 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 
694 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  22.05 
 
 
307 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  30.61 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.99 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.42 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  22.48 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.09 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.15 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  27.24 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 
680 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.22 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  31.47 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.52 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  30.77 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  26.03 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.55 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>