118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8770 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  100 
 
 		 331 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  60.73 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.98 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.38 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.78 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.34 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  46.5 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.82 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  35.55 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  34.97 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.36 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  35.16 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  35.26 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  34.68 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.77 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  34.68 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.3 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  40.79 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  35.88 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.67 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.55 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  30.58 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  34.24 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  32 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  27.24 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  25.15 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.65 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.65 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.65 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  27.23 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.7 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  25.19 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.45 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  25.84 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  27.43 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  32.64 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  26.91 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  27.98 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.15 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  29.64 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  26.24 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  25.4 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  27.57 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.21 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 694 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  26.34 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  28.57 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.44 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.38 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.46 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.02 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>