75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2854 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 349 aa  680    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  34.78 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.35 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25.91 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.35 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.52 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.43 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  24.28 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  23.32 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2888  putative UDP-glucose 4-epimerase  23.65 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.36 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  21.37 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.28 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  26.92 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.19 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  20.97 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  28.93 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  22.73 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.74 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  28.93 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  29.38 
 
 		 341 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  24.45 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  21.89 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  28.43 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  28.43 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  29.9 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  27.09 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  28.87 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.17 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.63 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0694  NAD dependent epimerase/dehydratase family  21.55 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.62 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.62 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.94 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>