More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2030 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  70.07 
 
 
313 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 
321 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 
293 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
322 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.17 
 
 
327 aa  249  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
299 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  33.12 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
297 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
297 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 
296 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.69 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  29.84 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
302 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
282 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
296 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
309 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
290 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
295 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
279 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
295 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  26.16 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  30.12 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  30.43 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0495  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  39.35 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  38.04 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  35.22 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  26.48 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  32.7 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  36.02 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  32.75 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  30.95 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  34.12 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  29.28 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  32.05 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  29.28 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  32.09 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  31.87 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  26.79 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  38.99 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  31.93 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  28.73 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  36.13 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  33.95 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  32.72 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  27.07 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  27.13 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  32.69 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  31.36 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.16 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  25.14 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  28.49 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  29.12 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  29.51 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  24.84 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  33.94 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>