More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3526 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.45 
 
 
283 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
290 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.14 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
300 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
299 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
279 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
305 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
290 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
301 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  27.64 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  27.53 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  27.54 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  26.13 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.36 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  27.85 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  31.38 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  31.11 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  28.66 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  33.52 
 
 
332 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  30.85 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  30.37 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  29.08 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  32.43 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  26.91 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  30.04 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  30.57 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  31.87 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  26.33 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.21 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185672  normal  0.626445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  28.94 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  27.32 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>