More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0938 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.32 
 
 
292 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
296 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.75 
 
 
300 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
279 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
299 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
290 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
296 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
295 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
282 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
292 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
292 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  34.44 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
302 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
321 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
312 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
322 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
309 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
297 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
295 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 
290 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  33.77 
 
 
299 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
301 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
327 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  32.29 
 
 
280 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
315 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  30.33 
 
 
297 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.79 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
292 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
303 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
283 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
314 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.57 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  35.56 
 
 
336 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  27.8 
 
 
333 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  35.39 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  27.1 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  29.18 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  34.83 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
506 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  34.08 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  34.66 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  37.2 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  27.83 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  30.53 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  33.71 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.57 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  28.93 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  32.78 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  28.06 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  33.52 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  29.92 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  33.91 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>