More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0789 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
327 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.36 
 
 
321 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.72 
 
 
322 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  50.17 
 
 
293 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  52.72 
 
 
313 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
315 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.58 
 
 
292 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
299 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
290 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
295 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
296 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
302 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
305 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
295 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
292 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
297 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  29.26 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
282 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  28.2 
 
 
297 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
279 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
309 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  27.45 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  35.67 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  35.67 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  35.03 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  27.27 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  33.76 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  36.71 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.28 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  34.25 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  28.88 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  27.22 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  28.31 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  24.05 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.7 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  31.45 
 
 
327 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  33.33 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10113  GDP-mannose 4,6-dehydratase gca  27.37 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  27.86 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  28.82 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  28.81 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  33.96 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  34.78 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0595  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  28.98 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  34.29 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  30.38 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  29.52 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  24.84 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>