More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1700 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  100 
 
 
304 aa  628  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.01 
 
 
304 aa  624  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 
298 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.33 
 
 
298 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.92 
 
 
296 aa  358  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  57.81 
 
 
298 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.24 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.44 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.9 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.9 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.04 
 
 
297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  52.35 
 
 
322 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  52.35 
 
 
322 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  52.35 
 
 
322 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  53.2 
 
 
297 aa  299  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  52 
 
 
322 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  52.28 
 
 
338 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  52.28 
 
 
338 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  52.28 
 
 
338 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
300 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.84 
 
 
321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0750075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  47.97 
 
 
303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.84 
 
 
321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.84 
 
 
321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20732  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.49 
 
 
323 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575766  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.66 
 
 
288 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.04 
 
 
266 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
322 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780042  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.33 
 
 
322 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639146  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 
303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.01 
 
 
324 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177017  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.51 
 
 
288 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.85 
 
 
295 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
290 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.22 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
315 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
326 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
303 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  35.74 
 
 
304 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  34.12 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
319 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.79 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
338 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
319 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
334 aa  122  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
326 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  32.37 
 
 
319 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
326 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.4 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
326 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  31.38 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
340 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.67 
 
 
328 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
333 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
326 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.55 
 
 
327 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
328 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
326 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
326 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
320 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
411 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
314 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.39 
 
 
335 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
413 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
334 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  25.3 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
334 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
369 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
327 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0524075  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1763  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.52 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.88 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  29.36 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  28.47 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
310 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
281 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.42 
 
 
335 aa  93.6  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1426  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.3 
 
 
344 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.218911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
417 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
336 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>