More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1050 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
338 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.86 
 
 
322 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 
315 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0524075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  39.13 
 
 
319 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 
342 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  38.01 
 
 
304 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 
319 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.73 
 
 
319 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  37.38 
 
 
303 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
315 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
303 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
326 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.9 
 
 
294 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
294 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
320 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.03 
 
 
308 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
322 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  34.62 
 
 
322 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  31.04 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  31.04 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  31.04 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  31.04 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  31.04 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  31.04 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.42 
 
 
322 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  36.42 
 
 
322 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.42 
 
 
322 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.75 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  36.75 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  36.75 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  36.75 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  34.25 
 
 
303 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
313 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
340 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
305 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  32.34 
 
 
304 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  32.7 
 
 
298 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
298 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
297 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
304 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
298 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
303 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
288 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
306 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  35.91 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
330 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639146  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177017  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.97 
 
 
323 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575766  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
321 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0750075  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
321 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
321 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20732  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
292 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
290 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.76 
 
 
322 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
295 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.35 
 
 
323 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
266 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
326 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
291 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  28.18 
 
 
329 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
303 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  27.89 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  24.71 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.32 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1611  GDP-mannose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.01 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 
324 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  28.66 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  29.6 
 
 
328 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13001  putative GDP-D-mannose dehydratase  26.34 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  29.38 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1763  GDP-mannose 4,6-dehydratase  25.89 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
329 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
288 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3850  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  25.54 
 
 
303 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  22.82 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>