More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5495 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
329 aa  640    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.25 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.11 
 
 
330 aa  262  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.79 
 
 
324 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45 
 
 
323 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.5 
 
 
325 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.7 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.71 
 
 
360 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.64 
 
 
327 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.71 
 
 
359 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.87 
 
 
339 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.36 
 
 
362 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.2 
 
 
333 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.49 
 
 
332 aa  245  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.82 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  44.67 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.2 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.06 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.49 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  43.11 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.72 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.64 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.58 
 
 
348 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  38.58 
 
 
348 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.42 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.72 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 
345 aa  242  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.23 
 
 
355 aa  242  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.38 
 
 
334 aa  242  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 
342 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 
327 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.33 
 
 
328 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 
364 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.04 
 
 
342 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.52 
 
 
356 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.54 
 
 
358 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.44 
 
 
331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.95 
 
 
360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.95 
 
 
344 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.24 
 
 
327 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1085  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.33 
 
 
372 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.96 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.84 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.9 
 
 
328 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.38 
 
 
326 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  40.72 
 
 
355 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.42 
 
 
372 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.72 
 
 
344 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.4 
 
 
350 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.48 
 
 
368 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  41.81 
 
 
363 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.12 
 
 
328 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.09 
 
 
372 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.72 
 
 
368 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.83 
 
 
331 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.51 
 
 
372 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.52 
 
 
371 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.17 
 
 
322 aa  236  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5860  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  40.17 
 
 
401 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.14 
 
 
360 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.94 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.28 
 
 
335 aa  235  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.24 
 
 
361 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.42 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.95 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.95 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.98 
 
 
328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.12 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.76 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.39 
 
 
345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.43 
 
 
373 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.42 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.43 
 
 
373 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.77 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.713411  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2623  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.86 
 
 
373 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.77 
 
 
370 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.3 
 
 
368 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.95 
 
 
360 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.92 
 
 
340 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.51 
 
 
373 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.77 
 
 
371 aa  232  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.12 
 
 
373 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.54 
 
 
360 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0821  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.2 
 
 
372 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1136  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40 
 
 
379 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.77 
 
 
346 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
329 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.3 
 
 
344 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.08 
 
 
371 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.62 
 
 
353 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.42 
 
 
369 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.83 
 
 
363 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.42 
 
 
346 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.53 
 
 
362 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  38.04 
 
 
370 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.3 
 
 
347 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.14 
 
 
347 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.390497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>