More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0397 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 342 aa  703    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.77 
 
 		 339 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.26 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  56.98 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.6 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.34 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.94 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.2 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.1 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.89 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  56.34 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 		 368 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.74 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 		 344 aa  391  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.74 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  57.61 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.74 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.74 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.13 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.71 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.49 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.24 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.01 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.72 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.2 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.96 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.55 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43847  predicted protein  55.1 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379971  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.67 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.17 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.67 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  53.51 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.49 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.9 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.08 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.08 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.67 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.37 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 347 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.71 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.53 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.1 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.28 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.08 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.87 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.86 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.17 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.45 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0082  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  53.33 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  54.2 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.8 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.29 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.92 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.98 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  52.98 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.01 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.57 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.25 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1312  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.3 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1136  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.82 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.28 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>