More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1306 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 
339 aa  697    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.77 
 
 
342 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.65 
 
 
350 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  54.09 
 
 
373 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 
353 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.23 
 
 
361 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
361 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.62 
 
 
351 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
346 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  56.59 
 
 
355 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.8 
 
 
361 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.68 
 
 
346 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  53.1 
 
 
361 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
348 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
360 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.49 
 
 
344 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.53 
 
 
360 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 
345 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 
348 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.59 
 
 
347 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 
348 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.06 
 
 
354 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 
348 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43847  predicted protein  53.06 
 
 
362 aa  374  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379971  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
343 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.76 
 
 
353 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
349 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.63 
 
 
359 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0082  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 
352 aa  374  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 
348 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 
348 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
369 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.3 
 
 
344 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.49 
 
 
360 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.75 
 
 
348 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.73 
 
 
354 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 
372 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.1 
 
 
345 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.51 
 
 
362 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 
372 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.18 
 
 
367 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 
343 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.59 
 
 
363 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.88 
 
 
364 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.2 
 
 
360 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0571  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 
380 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51 
 
 
371 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.17 
 
 
346 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.19 
 
 
344 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.62 
 
 
368 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.71 
 
 
357 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  52.6 
 
 
363 aa  368  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.3 
 
 
344 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
364 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52 
 
 
365 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.47 
 
 
362 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.43 
 
 
372 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.91 
 
 
360 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.92 
 
 
362 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.87 
 
 
346 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.2 
 
 
361 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.71 
 
 
344 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 
367 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.18 
 
 
349 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.17 
 
 
346 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
363 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.71 
 
 
375 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4199  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.28 
 
 
374 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1221  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.59 
 
 
355 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.155645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.43 
 
 
345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2291  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.76213  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2608  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.17 
 
 
397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000935009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.89 
 
 
347 aa  361  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.8 
 
 
347 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.73 
 
 
367 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
373 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1085  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
372 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
371 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
373 aa  359  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.89 
 
 
347 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 
349 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.89 
 
 
347 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
371 aa  358  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 
370 aa  358  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2471  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.58 
 
 
375 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236107  normal  0.502765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.18 
 
 
361 aa  358  8e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0589  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.86 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>