More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4012 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 357 aa  742    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.76 
 
 		 346 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  82.02 
 
 		 346 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  81.51 
 
 		 346 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.62 
 
 		 346 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.62 
 
 		 346 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.71 
 
 		 344 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.15 
 
 		 344 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.03 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.03 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  78.59 
 
 		 355 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.46 
 
 		 343 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.31 
 
 		 343 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.91 
 
 		 344 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.75 
 
 		 344 aa  578  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.84 
 
 		 345 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.79 
 
 		 344 aa  570  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.72 
 
 		 345 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.12 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.12 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.12 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.56 
 
 		 348 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 346 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  73.6 
 
 		 346 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.21 
 
 		 348 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  72.96 
 
 		 347 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.03 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.16 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.21 
 
 		 348 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.03 
 
 		 347 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.03 
 
 		 347 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.6 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.31 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  68.63 
 
 		 344 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1312  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  56.21 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.31 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.81 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  55.27 
 
 		 373 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.18 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.24 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.24 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43847  predicted protein  55.21 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379971  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.24 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.08 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.08 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.93 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  54.83 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1136  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.29 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.54 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0302  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.93 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.26 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4001  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.79 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.71 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.97 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.77 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.39 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3269  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.74 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.96 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  53.26 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.46 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0412  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.91 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.33 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.09 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.52 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.26 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.4 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.67 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.68 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3149  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.48 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.98 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.12 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  53.54 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.22 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.14 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>