More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5682 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 323 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.31 
 
 		 323 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  86.07 
 
 		 323 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.5 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.36 
 
 		 327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.49 
 
 		 327 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.6 
 
 		 368 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.78 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.06 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.13 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.13 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.06 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.61 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.18 
 
 		 325 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.44 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.87 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.32 
 
 		 324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.94 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.49 
 
 		 324 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.19 
 
 		 323 aa  394  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  56.68 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.49 
 
 		 321 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.08 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 		 322 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.19 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.74 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.55 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.92 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.61 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.55 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.68 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.21 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  55.43 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.57 
 
 		 344 aa  374  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.08 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.46 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.49 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.52 
 
 		 359 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  52.59 
 
 		 373 aa  361  9e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.47 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 		 328 aa  359  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 		 333 aa  358  7e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 		 363 aa  358  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.66 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.35 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.66 
 
 		 344 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.23 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  53.23 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.8 
 
 		 358 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.77 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.15 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.2 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.29 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.04 
 
 		 363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 		 353 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.4 
 
 		 331 aa  351  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.01 
 
 		 329 aa  351  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.91 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.72 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.72 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  54.6 
 
 		 340 aa  348  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52 
 
 		 362 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.37 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>