More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3970 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 348 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.93 
 
 		 347 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.93 
 
 		 347 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.22 
 
 		 347 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.93 
 
 		 347 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  97.7 
 
 		 348 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.22 
 
 		 347 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.93 
 
 		 347 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 348 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.93 
 
 		 347 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  95.69 
 
 		 348 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  95.69 
 
 		 348 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 348 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  94.25 
 
 		 347 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.22 
 
 		 347 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  83.91 
 
 		 347 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  83.33 
 
 		 347 aa  607  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  81.82 
 
 		 347 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.72 
 
 		 344 aa  569  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.43 
 
 		 346 aa  569  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.97 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  77.1 
 
 		 355 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.39 
 
 		 346 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.68 
 
 		 346 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.71 
 
 		 345 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.97 
 
 		 344 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75 
 
 		 357 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.71 
 
 		 344 aa  557  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.42 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.42 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.61 
 
 		 343 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.58 
 
 		 346 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  71.84 
 
 		 348 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.73 
 
 		 343 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.76 
 
 		 344 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.47 
 
 		 346 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  73.47 
 
 		 346 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  72.59 
 
 		 345 aa  532  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  70.71 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  70.97 
 
 		 344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  59.47 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.88 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.88 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.94 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.3 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.57 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.72 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.82 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.06 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.04 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.04 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.04 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.04 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.24 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.88 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.01 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.3 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  55.88 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.05 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.34 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.64 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.43 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.01 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.72 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.4 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.95 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.34 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.01 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0082  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3269  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.19 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.15 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1312  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.97 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.96 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.57 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.96 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.83 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4199  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.38 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43847  predicted protein  56.52 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379971  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.07 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.04 
 
 		 323 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>