More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2839 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
333 aa  695    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.58 
 
 
331 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.81 
 
 
330 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.94 
 
 
324 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
324 aa  319  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
323 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.25 
 
 
360 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.38 
 
 
335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.92 
 
 
322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.48 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.53 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.96 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.95 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  50.15 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.24 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.65 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.39 
 
 
380 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
328 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.28 
 
 
325 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.08 
 
 
338 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.59 
 
 
327 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.6 
 
 
331 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 
342 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.26 
 
 
344 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.9 
 
 
342 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.94 
 
 
327 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  48.05 
 
 
340 aa  295  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.65 
 
 
368 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 
361 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.69 
 
 
328 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.3 
 
 
353 aa  291  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.01 
 
 
348 aa  291  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.32 
 
 
340 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 
340 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.84 
 
 
340 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.84 
 
 
340 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 
364 aa  289  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.55 
 
 
340 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.64 
 
 
345 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 
351 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 
351 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.71 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  47.06 
 
 
373 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
360 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 
340 aa  285  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.81 
 
 
323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.74 
 
 
361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.18 
 
 
347 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.48 
 
 
350 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.77 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 
342 aa  282  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.9 
 
 
361 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 
323 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.71 
 
 
326 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 
323 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.09 
 
 
360 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1790  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.86 
 
 
372 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.13 
 
 
349 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 
367 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1827  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.24 
 
 
330 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 
349 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.9 
 
 
360 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.35 
 
 
339 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.38 
 
 
370 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.85 
 
 
373 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.16 
 
 
372 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
373 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.92 
 
 
371 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.02 
 
 
344 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.32 
 
 
372 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.44 
 
 
359 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.58 
 
 
344 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 
363 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.57 
 
 
350 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
362 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.64 
 
 
369 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.54 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.63 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.75 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.8 
 
 
360 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.8 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.25 
 
 
370 aa  272  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.38 
 
 
373 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.38 
 
 
373 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
363 aa  272  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.38 
 
 
373 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.38 
 
 
373 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.02 
 
 
349 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.73 
 
 
328 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2291  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
373 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.76213  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.48 
 
 
353 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>