More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4203 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 340 aa  700    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  68.34 
 
 		 342 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  68.47 
 
 		 340 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.27 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  70.46 
 
 		 380 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.67 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.67 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1827  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.87 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.77 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  56.1 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.75 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.63 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.54 
 
 		 359 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.28 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.1 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.97 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.46 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.45 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.15 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.88 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.713411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.09 
 
 		 359 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0821  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.73 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.81 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  56.23 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.47 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.18 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.6 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.37 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.37 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 360 aa  384  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.31 
 
 		 349 aa  384  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1281  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.46 
 
 		 387 aa  381  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  52.26 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  55.78 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.61 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0652  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.63 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.71 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.12 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2471  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.97 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236107  normal  0.502765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  52.6 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.31 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.67 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1790  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1085  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.29 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0082  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 373 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13991  gdpmannose 4,6-dehydratase  50.27 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.193432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1136  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.92 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.98 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01959  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2346  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1179  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1588  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3149  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1009  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 373 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.19 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2349  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.6 
 
 		 374 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3269  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.45 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  52.44 
 
 		 370 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2291  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.76213  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2093  hypothetical protein  53.3 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1298  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.26 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.388412  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.4 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.52 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4199  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.86 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  50.29 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>