More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2872 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 
340 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  84.75 
 
 
342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  81.9 
 
 
344 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.71 
 
 
333 aa  427  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.54 
 
 
330 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.71 
 
 
363 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.89 
 
 
329 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.19 
 
 
331 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.77 
 
 
324 aa  411  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.63 
 
 
324 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.92 
 
 
328 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.19 
 
 
325 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.89 
 
 
326 aa  401  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.79 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.15 
 
 
323 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.37 
 
 
322 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.62 
 
 
334 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 
327 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.19 
 
 
362 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.66 
 
 
327 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.89 
 
 
362 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.05 
 
 
359 aa  360  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.95 
 
 
358 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
339 aa  359  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
339 aa  359  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
343 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
343 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.58 
 
 
361 aa  358  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.75 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.35 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.35 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.15 
 
 
327 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.44 
 
 
345 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.79 
 
 
342 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  51.05 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.05 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.22 
 
 
328 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.23 
 
 
338 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.03 
 
 
328 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.17 
 
 
345 aa  348  9e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 
351 aa  348  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.8 
 
 
328 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
323 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.96 
 
 
329 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
350 aa  346  3e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.79 
 
 
323 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.42 
 
 
368 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
349 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.11 
 
 
340 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.56 
 
 
348 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  49.14 
 
 
373 aa  339  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.82 
 
 
335 aa  339  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
343 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.99 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.98 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.9 
 
 
332 aa  335  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.74 
 
 
323 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  49.71 
 
 
355 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.05 
 
 
344 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.01 
 
 
340 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
362 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  50 
 
 
361 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.43 
 
 
363 aa  332  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.3 
 
 
355 aa  332  6e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
348 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
334 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
348 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.93 
 
 
357 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
361 aa  331  8e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
364 aa  331  9e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 
347 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 
347 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
347 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
347 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.43 
 
 
347 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
347 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
347 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
347 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
346 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
360 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
347 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.43 
 
 
346 aa  328  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.55 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.63 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.56 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.26 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.59 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.55 
 
 
348 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.99 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.71 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>