More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1711 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 
330 aa  683    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  77.12 
 
 
324 aa  524  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.39 
 
 
324 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.35 
 
 
325 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.29 
 
 
322 aa  498  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.05 
 
 
321 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.3 
 
 
323 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.9 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.64 
 
 
368 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.54 
 
 
340 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.76 
 
 
368 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.25 
 
 
342 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.21 
 
 
334 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.33 
 
 
333 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.7 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.08 
 
 
327 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.11 
 
 
331 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.44 
 
 
327 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.9 
 
 
329 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.25 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.82 
 
 
345 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 
362 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.18 
 
 
361 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.99 
 
 
343 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.99 
 
 
343 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.88 
 
 
328 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.37 
 
 
323 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.28 
 
 
358 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 
359 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  57.89 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.26 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.62 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.59 
 
 
328 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.55 
 
 
350 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.94 
 
 
328 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.44 
 
 
323 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.11 
 
 
360 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.63 
 
 
342 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.62 
 
 
328 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.74 
 
 
326 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.77 
 
 
362 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.44 
 
 
348 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  59.44 
 
 
348 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.51 
 
 
338 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
351 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.87 
 
 
364 aa  384  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 
349 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 
340 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.64 
 
 
340 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 
345 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.64 
 
 
368 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.48 
 
 
349 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.71 
 
 
335 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.05 
 
 
340 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 
343 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
349 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  55.12 
 
 
355 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.52 
 
 
361 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.05 
 
 
340 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 
360 aa  374  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 
346 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.75 
 
 
380 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.82 
 
 
344 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.72 
 
 
346 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.99 
 
 
346 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  55.46 
 
 
361 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.31 
 
 
354 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  54.78 
 
 
363 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
355 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 
344 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.87 
 
 
353 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55 
 
 
360 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.47 
 
 
369 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 
346 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.62 
 
 
346 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  55.19 
 
 
340 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.76 
 
 
362 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 
361 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.96 
 
 
344 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 
361 aa  364  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.03 
 
 
344 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.99 
 
 
347 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 
345 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
348 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  53.62 
 
 
346 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 
347 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 
343 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52 
 
 
373 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.93 
 
 
344 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
347 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 
347 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.43 
 
 
344 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 
363 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.33 
 
 
372 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
347 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.33 
 
 
372 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
347 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>