More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2622 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 
344 aa  712    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  81.9 
 
 
340 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.36 
 
 
342 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.9 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.63 
 
 
333 aa  435  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.63 
 
 
363 aa  435  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.14 
 
 
329 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.56 
 
 
324 aa  428  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.45 
 
 
325 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.44 
 
 
324 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.88 
 
 
331 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.61 
 
 
321 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.92 
 
 
328 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.18 
 
 
323 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.88 
 
 
322 aa  393  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.63 
 
 
326 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.62 
 
 
334 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.58 
 
 
361 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 
359 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
327 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.91 
 
 
362 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.2 
 
 
362 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.92 
 
 
327 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.87 
 
 
358 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.17 
 
 
342 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 
328 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 
360 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 
327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.88 
 
 
329 aa  361  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.95 
 
 
348 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  51.95 
 
 
348 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.19 
 
 
328 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.62 
 
 
368 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.63 
 
 
380 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
339 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
343 aa  359  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
343 aa  359  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
339 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.9 
 
 
338 aa  358  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
368 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.87 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.38 
 
 
351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 
328 aa  353  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.02 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
345 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.81 
 
 
373 aa  348  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.81 
 
 
373 aa  348  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.18 
 
 
323 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.16 
 
 
345 aa  347  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
373 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
350 aa  345  6e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  49.71 
 
 
373 aa  345  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.41 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.72 
 
 
368 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.01 
 
 
360 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.29 
 
 
344 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
343 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.66 
 
 
323 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.72 
 
 
363 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  49.71 
 
 
355 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
361 aa  342  7e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.64 
 
 
364 aa  342  7e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
344 aa  341  9e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.47 
 
 
370 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.72 
 
 
349 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
362 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  51.01 
 
 
361 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1482  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 
373 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246967  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 
373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 
373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 
373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 
373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.3 
 
 
340 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2291  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.3 
 
 
373 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.76213  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.03 
 
 
351 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.03 
 
 
351 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.72 
 
 
367 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01959  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2346  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.3 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1588  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1009  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1179  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.84 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 
371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
372 aa  335  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
361 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
348 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.69 
 
 
348 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
332 aa  334  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.29 
 
 
360 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  50.28 
 
 
374 aa  334  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 
361 aa  333  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
355 aa  333  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.35 
 
 
367 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>