More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1332 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.47 
 
 
296 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.47 
 
 
296 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.05 
 
 
297 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.32 
 
 
305 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.25 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.48 
 
 
296 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  57.09 
 
 
322 aa  315  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.57 
 
 
322 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  56.57 
 
 
322 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.57 
 
 
322 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.98 
 
 
298 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  54.3 
 
 
298 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.33 
 
 
298 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.38 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780042  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.38 
 
 
322 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639146  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  57.04 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  57.04 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  57.04 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.38 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0750075  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.86 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.86 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20732  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  53.2 
 
 
304 aa  299  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.86 
 
 
304 aa  298  6e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.03 
 
 
323 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575766  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.37 
 
 
303 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 
303 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.36 
 
 
324 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177017  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
288 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
300 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
295 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
288 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
292 aa  257  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.41 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.3 
 
 
291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.96 
 
 
303 aa  252  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.07 
 
 
290 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
342 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
303 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
294 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.77 
 
 
294 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  33.66 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  32.89 
 
 
304 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
308 aa  129  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  35.03 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
319 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
319 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
298 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
321 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.21 
 
 
323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 
329 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  31.8 
 
 
308 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
306 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13001  putative GDP-D-mannose dehydratase  28.95 
 
 
322 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.56 
 
 
323 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.56 
 
 
322 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
334 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
314 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
315 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  26.96 
 
 
328 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
326 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
340 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
326 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
281 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  30.64 
 
 
329 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
329 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
320 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
326 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  27.3 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
411 aa  97.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
413 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1448  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  29.13 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000898227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  26.64 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3850  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  28.74 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  29.04 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  29.41 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  30.74 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10113  GDP-mannose 4,6-dehydratase gca  30.42 
 
 
318 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_13420  predicted protein  29.76 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213711  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  30.09 
 
 
337 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  25.78 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
320 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  29.91 
 
 
332 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  27.76 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>