More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13001 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13001  putative GDP-D-mannose dehydratase  100 
 
 
322 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.48 
 
 
340 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.17 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.77 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.48 
 
 
340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.6 
 
 
347 aa  308  8e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.44 
 
 
324 aa  305  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.28 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.36 
 
 
323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.6 
 
 
328 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.26 
 
 
349 aa  298  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48 
 
 
330 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 
338 aa  295  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
325 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.59 
 
 
349 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 
327 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.86 
 
 
327 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 
322 aa  293  3e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.4 
 
 
351 aa  291  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.25 
 
 
368 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.3 
 
 
368 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.96 
 
 
351 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.96 
 
 
351 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.22 
 
 
327 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.27 
 
 
364 aa  288  9e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.58 
 
 
348 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.9 
 
 
329 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  44.55 
 
 
340 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 
350 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.52 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.77 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.2 
 
 
360 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.69 
 
 
334 aa  285  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.24 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
362 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1221  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.81 
 
 
355 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.155645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
362 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  46.06 
 
 
348 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.06 
 
 
348 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
356 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.48 
 
 
342 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.06 
 
 
359 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.89 
 
 
342 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.97 
 
 
345 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.77 
 
 
335 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.82 
 
 
360 aa  276  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1482  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.3 
 
 
373 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246967  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.27 
 
 
340 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.48 
 
 
384 aa  275  8e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.4 
 
 
373 aa  275  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.95 
 
 
360 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.74 
 
 
373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.74 
 
 
373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
363 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.44 
 
 
358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20961  GDP-D-mannose dehydratase  44.78 
 
 
350 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.19 
 
 
372 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.03 
 
 
355 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.3 
 
 
373 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.09 
 
 
371 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 
344 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.14 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1312  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.79 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.26 
 
 
369 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.41 
 
 
370 aa  268  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.95 
 
 
374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.32 
 
 
362 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.36 
 
 
360 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  42.73 
 
 
361 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.73 
 
 
353 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 
361 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
354 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 
361 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.32 
 
 
360 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.98 
 
 
367 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.07 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.07 
 
 
360 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2093  hypothetical protein  41.19 
 
 
372 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.03 
 
 
362 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.54 
 
 
361 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13681  gdpmannose 4,6-dehydratase  43.02 
 
 
368 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.18 
 
 
361 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.03 
 
 
368 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1281  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.27 
 
 
387 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5860  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  41.03 
 
 
401 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.21 
 
 
373 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.33 
 
 
367 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2623  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.92 
 
 
373 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1298  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.24 
 
 
374 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.388412  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.39 
 
 
367 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.93 
 
 
328 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.01 
 
 
372 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1827  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.39 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  0.0129962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>