More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4013 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
290 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.4 
 
 
288 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.89 
 
 
288 aa  360  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.32 
 
 
295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.98 
 
 
298 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  47.46 
 
 
298 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  45.12 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.8 
 
 
305 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.92 
 
 
305 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.97 
 
 
298 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.03 
 
 
296 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.28 
 
 
303 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.76 
 
 
296 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.76 
 
 
296 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.66 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  44.67 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  43.79 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.79 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.79 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.08 
 
 
300 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  44.19 
 
 
304 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
304 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 
297 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  44.84 
 
 
338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  44.84 
 
 
338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  44.84 
 
 
338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
292 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  44.07 
 
 
297 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
322 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780042  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
322 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639146  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
323 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575766  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177017  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0750075  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20732  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.72 
 
 
266 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  37.87 
 
 
303 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.09 
 
 
294 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
294 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  35.29 
 
 
304 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
315 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
326 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
308 aa  139  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.51 
 
 
323 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.77 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
319 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
326 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
326 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
334 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
298 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  32.22 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
326 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
326 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
324 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
327 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0524075  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
314 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
313 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.77 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
326 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
338 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.08 
 
 
335 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
326 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  29.67 
 
 
316 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
306 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.53 
 
 
333 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.89 
 
 
335 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
333 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 
329 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
332 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
315 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  27.61 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.94 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
322 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
334 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  28.75 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
327 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
281 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
315 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  25.29 
 
 
342 aa  92.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
311 aa  92  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>