More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1703 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 
305 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.36 
 
 
305 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.93 
 
 
303 aa  285  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 
296 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.57 
 
 
291 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.3 
 
 
300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.67 
 
 
288 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  43.45 
 
 
298 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.58 
 
 
297 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.14 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.08 
 
 
322 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  41.08 
 
 
322 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  41.08 
 
 
322 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.08 
 
 
322 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
296 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
296 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  42.52 
 
 
297 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
303 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  41.58 
 
 
303 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
298 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  41.11 
 
 
338 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  41.11 
 
 
338 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  41.11 
 
 
338 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
290 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
288 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 
321 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0750075  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
322 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780042  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
321 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
321 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.8 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575766  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  41.22 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639146  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 
304 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.38 
 
 
266 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
324 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177017  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
315 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
303 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  28.33 
 
 
304 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  28.85 
 
 
303 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
319 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
319 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
335 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
298 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.55 
 
 
335 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
338 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
326 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
326 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
326 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
320 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  27.65 
 
 
319 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.41 
 
 
335 aa  102  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
336 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
308 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.16 
 
 
336 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
326 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
333 aa  99.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.55 
 
 
322 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.92 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.59 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.34 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.3 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.41 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0524075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.21 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
314 aa  85.5  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
411 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1448  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  26.28 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000898227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  27.96 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10113  GDP-mannose 4,6-dehydratase gca  26.5 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3850  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  25.96 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1306  GDP-mannose 4,6-dehydratase  24.85 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.86 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  25.33 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  25.62 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  25.62 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>