More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5389 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 326 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  76.7 
 
 		 329 aa  477  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  76.7 
 
 		 329 aa  477  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  76.05 
 
 		 329 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  74.6 
 
 		 325 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  68.85 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  66.35 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  63.02 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 320 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  50.48 
 
 		 319 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  47.6 
 
 		 323 aa  279  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  42.63 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  44.03 
 
 		 332 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.81 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  38.61 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  46.01 
 
 		 324 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  46.95 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  44.3 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  43.71 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  40.82 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  40.13 
 
 		 325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  41.93 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  43.79 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  39.18 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  41.14 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  36.78 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  46.33 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  42.48 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  42.45 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  44.52 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  41.25 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  40.13 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  37.74 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  45.74 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  45.21 
 
 		 337 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  44.24 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  45.36 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  42.01 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  44.65 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  41.88 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  43.04 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  41.19 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  41.82 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  38.08 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  36.73 
 
 		 329 aa  222  6e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  43.75 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  43.67 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  38.8 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  46.05 
 
 		 327 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 323 aa  222  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  38.05 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  45.03 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  41.41 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  38.77 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  42.22 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  42.6 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  44.13 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  39.18 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>