More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5175 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  98.48 
 
 		 329 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 329 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  98.48 
 
 		 329 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  80.86 
 
 		 325 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  76.19 
 
 		 326 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  71.7 
 
 		 322 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  69.35 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  63.67 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  51.43 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  46.99 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  44.76 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  40.94 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.07 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.07 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  39.14 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  37.12 
 
 		 328 aa  241  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  39.75 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  44.06 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  42.06 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  40.12 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  40.24 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.58 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  39.83 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  45.9 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  40.61 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  39.57 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  41.23 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  43.99 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  39.62 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  39.56 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  39.25 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  41.51 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  39.41 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  38.69 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  43.57 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  44.11 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  43.25 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  37.27 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  39.62 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  37.23 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  39.31 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  41.12 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  38.95 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4069  hypothetical protein  41.87 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487038  normal  0.116036 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  40.49 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  37.92 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  39.35 
 
 		 337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  40.5 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  39.05 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  39.05 
 
 		 337 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  43.3 
 
 		 329 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  41.42 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  39.31 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  39.05 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  39.82 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  44.08 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  39.02 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  43.26 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  41.28 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  39.63 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>