More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 332 aa  670    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  59.69 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  59.81 
 
 		 323 aa  361  9e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  55.14 
 
 		 336 aa  322  7e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  46.41 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  48.89 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  46.95 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1198  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 318 aa  258  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 		 322 aa  258  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  46.3 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  46.3 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  45.78 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  42.19 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.83 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  44.07 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  47.12 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  42.95 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  39.31 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  42.73 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  41.1 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  38.87 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  44.12 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  42.19 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  43.26 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  40.53 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  38.72 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  38.49 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  38.44 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  40.13 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  39.81 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  43.75 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  44.69 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  42.41 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  41.36 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  38.61 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  42.72 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  42.68 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  42.32 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  42.38 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  40.69 
 
 		 336 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  42.55 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  43.26 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  44.75 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  43.57 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  45.16 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  45.74 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  41.38 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  39.54 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  45.25 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  39.88 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  42.35 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  41.1 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  41.5 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  41.1 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  38.86 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  38.86 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>