More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1198 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1198  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 318 aa  611  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  52.05 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  41.87 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  43.3 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  43.3 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  40.37 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  39.45 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  40.37 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  44.94 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  38.46 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  43.3 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  39.5 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  39.12 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  36.92 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  40.94 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  42.63 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  37.93 
 
 		 326 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  43.17 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  42.07 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  37.72 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  42.59 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  44.87 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  46.3 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  38.24 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  42.12 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  38.08 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  38.24 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  40.44 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  39.81 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  37.89 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  43.79 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  37.62 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  41.8 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  38.24 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  40.69 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  43.73 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  41.51 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  41.49 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  41.16 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  44.24 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  41.51 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  43.96 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  45.16 
 
 		 339 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  42.63 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  42.25 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  38.32 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 		 342 aa  206  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  40.32 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  40.94 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  43.71 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  37.85 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  40.19 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  42.55 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>