More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1401 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
325 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  81.23 
 
 
329 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  81.23 
 
 
329 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  80.91 
 
 
329 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  74.6 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  68.35 
 
 
322 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  66.36 
 
 
326 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  60.38 
 
 
333 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  53.63 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  52.52 
 
 
320 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 
323 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  46.41 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
336 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
337 aa  263  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  39.37 
 
 
328 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 
328 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 
328 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  45.57 
 
 
354 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  43.98 
 
 
329 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 
328 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  41.95 
 
 
330 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  41.95 
 
 
330 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 
330 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 
330 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 
330 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 
330 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 
328 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 
330 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  40.44 
 
 
326 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  41.03 
 
 
330 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 
321 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  42.81 
 
 
333 aa  245  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  42.94 
 
 
328 aa  245  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  44.06 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  38.23 
 
 
326 aa  242  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 
329 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  43.38 
 
 
338 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 
328 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 
326 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 
334 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 
328 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  42.37 
 
 
332 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 
351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  38.68 
 
 
321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  43.73 
 
 
331 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 
330 aa  238  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 
330 aa  238  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 
330 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  42.41 
 
 
324 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 
323 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  43.34 
 
 
332 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  40.77 
 
 
337 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  39.56 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 
336 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 
337 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  44.34 
 
 
327 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  41.21 
 
 
353 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  39.82 
 
 
330 aa  235  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  40.48 
 
 
337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  40.48 
 
 
337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  39.25 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 
327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  43.49 
 
 
328 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  39.02 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  39.94 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  39.81 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  44.06 
 
 
320 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 
337 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  42.43 
 
 
336 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  42.06 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 
330 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.08 
 
 
330 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 
337 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  41.72 
 
 
339 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  41.77 
 
 
329 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 
323 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  42.77 
 
 
337 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.08 
 
 
330 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  41.77 
 
 
329 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 
324 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  43.37 
 
 
330 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  42.35 
 
 
373 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 
341 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  38.27 
 
 
339 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 
338 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 
325 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  42.14 
 
 
328 aa  228  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  42.14 
 
 
342 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>