More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA08350 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  618  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  96.66 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  36.64 
 
 
280 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
309 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
290 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
292 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
279 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
279 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.1 
 
 
292 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
295 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
295 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  31.44 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  27.53 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  27.69 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  28.46 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  26.13 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  25.93 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.59 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  23.3 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.26 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  30.86 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  31.32 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  27.78 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.45 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  25.71 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  28.98 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  24.73 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  24.79 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  26.96 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
362 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  27.94 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  28.8 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.35 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  29.28 
 
 
332 aa  59.7  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  29.35 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.58 
 
 
336 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  28.33 
 
 
324 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
346 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  27.72 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
355 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
368 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  29.48 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  24.69 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.49 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.97 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  25 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>