More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0249 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
303 aa  620  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
327 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
334 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
327 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
323 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
325 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13505  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  26.92 
 
 
364 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
333 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0595  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
297 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  28.96 
 
 
275 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
268 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
268 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 
279 aa  99  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
268 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
299 aa  99  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
282 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  29.73 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
560 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
268 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
274 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
277 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
278 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  31.58 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.950966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  29.25 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.92 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  33.14 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.72 
 
 
345 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.38 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
273 aa  89  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  33.94 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
313 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  30.74 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  30.54 
 
 
282 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.1 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.1 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1958  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
880 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0262576  hitchhiker  0.00141398 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  28.92 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  26.21 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  29.34 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  30.32 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  30.1 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>