More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3109 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 269 aa  553  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  91.45 
 
 		 269 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.35 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.13 
 
 		 273 aa  358  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.69 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.69 
 
 		 268 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.31 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.94 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.98 
 
 		 274 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.31 
 
 		 268 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  60.98 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.85 
 
 		 281 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.85 
 
 		 281 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.22 
 
 		 277 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  61.83 
 
 		 282 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  59.7 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.51 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.62 
 
 		 278 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.52 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.26 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.23 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.52 
 
 		 277 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  59.23 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.14 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.49 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  51.13 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.95 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.57 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.59 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.13 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.29 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.09 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  48.1 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  42.8 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.69 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.15 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 		 279 aa  204  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  43.58 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  41.02 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.63 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.16 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.25 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  45.13 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.66 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.42 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 560 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.4 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.05 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 375 aa  85.9  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.22 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  32.34 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  29.35 
 
 		 305 aa  72  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 347 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>