More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8562 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
303 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
300 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
279 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
282 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
297 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
279 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  30.35 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
302 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
301 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.7 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.48 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  32.71 
 
 
293 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.13 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.78 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  27.59 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.44 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.79 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.69 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  27.66 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.97 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.69 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  34.1 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.43 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  29.71 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  28.09 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.56 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  29.26 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  36 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.29 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.36 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.36 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.36 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  37.21 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  30.18 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  26.62 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>