More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1797 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.31 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  45.04 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.06 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.15 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.19 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.83 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.83 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  42.05 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.34 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.63 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  41.51 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.53 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.68 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  41.73 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.49 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.75 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  42.53 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.66 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.1 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  41.51 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.92 
 
 		 276 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.62 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  37.88 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.44 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  42.8 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.17 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.92 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 		 560 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.57 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.33 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.21 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  37.4 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.66 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.78 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.02 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.16 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.27 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  27.82 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.04 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>