More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4212 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.12 
 
 
278 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.17 
 
 
302 aa  285  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
255 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
247 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 
249 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
560 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.25 
 
 
263 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  34.43 
 
 
267 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
273 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
290 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
274 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  29.39 
 
 
280 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
266 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
256 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
278 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
278 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
280 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
267 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
272 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
269 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
277 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
278 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
269 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
276 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
276 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
282 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  29.57 
 
 
244 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  27.86 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  28.37 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.48 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
249 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
273 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.54 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  26.69 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  27.94 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  25.94 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.07 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  30.05 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.64 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.26 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.33 
 
 
357 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.92 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.62 
 
 
330 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.48 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
314 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  25.66 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>