More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0760 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
278 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.3 
 
 
267 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.68 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
272 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  52.36 
 
 
267 aa  248  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.26 
 
 
274 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.61 
 
 
278 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.37 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.38 
 
 
261 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.66 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 
273 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.11 
 
 
274 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.87 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.63 
 
 
269 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 
272 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
268 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
268 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
268 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
268 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.92 
 
 
273 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
282 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  36.98 
 
 
282 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.13 
 
 
269 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.08 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.58 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.32 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
275 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
271 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
265 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 
278 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  36.69 
 
 
275 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
277 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
281 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
281 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
261 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
266 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  35.48 
 
 
278 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.69 
 
 
277 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
280 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.61 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
278 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  37.76 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  36.1 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
278 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 
278 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  38.15 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  34.27 
 
 
275 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
295 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.41 
 
 
275 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  37.08 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.63 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
560 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
249 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
247 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.76 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.88 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
256 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
290 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
283 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
278 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
252 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
257 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.63 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
313 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.06 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>