More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1167 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.55 
 
 
256 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.96 
 
 
263 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.4 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  36.11 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.15 
 
 
267 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
249 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 
255 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
273 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
278 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
277 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
560 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
274 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
272 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
278 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
273 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
283 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  29.6 
 
 
280 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
280 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
278 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
278 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
295 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
261 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
273 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
252 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
268 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
281 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  30.77 
 
 
282 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
281 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
278 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
276 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  27.24 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  28.24 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.94 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
275 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.57 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
268 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
276 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
274 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  28.72 
 
 
305 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.84 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
299 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.78 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  26.56 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  29.95 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  30.05 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  29.1 
 
 
328 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
326 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
283 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>