More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2457 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.77 
 
 
278 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
302 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 
298 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 
249 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
278 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
274 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
278 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
274 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  31.49 
 
 
280 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
272 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  31.19 
 
 
275 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
268 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  30.72 
 
 
275 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
277 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
278 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
278 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
269 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.77 
 
 
273 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
560 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
269 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
268 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  34.68 
 
 
267 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.72 
 
 
263 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
277 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
268 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
282 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
275 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.14 
 
 
267 aa  99  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  31.64 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
271 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
276 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.67 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  29.93 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  29.36 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  31.42 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  30.26 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.47 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.26 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  32.83 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  32.64 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.16 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.87 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  33.83 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  29.81 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>