More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3413 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  46.59 
 
 
275 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.39 
 
 
279 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
268 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  43.94 
 
 
275 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 
268 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.93 
 
 
275 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.08 
 
 
268 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.24 
 
 
274 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 
277 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.54 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  44.19 
 
 
278 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.63 
 
 
282 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.45 
 
 
278 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  44.57 
 
 
282 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.66 
 
 
265 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.54 
 
 
269 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.4 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.4 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 
269 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.49 
 
 
268 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.11 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 
278 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
277 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 
278 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.44 
 
 
278 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.89 
 
 
273 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.51 
 
 
295 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 
277 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.69 
 
 
272 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  41.44 
 
 
280 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  42.59 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.48 
 
 
274 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.31 
 
 
279 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  42.98 
 
 
255 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  39.92 
 
 
244 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.85 
 
 
275 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 
273 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
274 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  39.75 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
276 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.84 
 
 
252 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.45 
 
 
273 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
276 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 
277 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.98 
 
 
270 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
277 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
272 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
560 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.95 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
247 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 
257 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  28.62 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  29.44 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  30.12 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>