More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4068 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.64 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  96.04 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.53 
 
 		 278 aa  540  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.17 
 
 		 278 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.97 
 
 		 277 aa  527  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.92 
 
 		 277 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  78.02 
 
 		 280 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.92 
 
 		 280 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.23 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.85 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  54.04 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.85 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.92 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.09 
 
 		 275 aa  295  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  52.57 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.65 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  58.46 
 
 		 282 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.08 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.07 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.65 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 		 269 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.6 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.03 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.95 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.12 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.15 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  56.49 
 
 		 311 aa  255  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.85 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.83 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  41.41 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.2 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.41 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.53 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.63 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  41.99 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.6 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.57 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.23 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.35 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  41.85 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.65 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.15 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  39.06 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.06 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 560 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.37 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.24 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.36 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.15 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>