More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3141 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
252 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.98 
 
 
249 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
290 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
560 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
274 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
247 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
268 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
268 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
277 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
268 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  32.78 
 
 
280 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
261 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
265 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
278 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
273 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
255 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
274 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
278 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
278 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
271 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
274 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
278 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
279 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  30.58 
 
 
275 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
268 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
261 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
267 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  30.58 
 
 
275 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
272 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  27.94 
 
 
278 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  30.33 
 
 
282 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  32.11 
 
 
267 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
269 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.37 
 
 
244 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
256 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
278 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
269 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.1 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  30.14 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.88 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.86 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.73 
 
 
273 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.77 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  27.54 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.99 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
315 aa  72  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
326 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.95 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.18 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.22 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  29.03 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>