More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5176 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.22 
 
 
276 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 
272 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.53 
 
 
273 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  44.87 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.55 
 
 
261 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
268 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.06 
 
 
268 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.61 
 
 
267 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
268 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  39.15 
 
 
275 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
268 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  38.37 
 
 
275 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 
265 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.92 
 
 
273 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 
282 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.92 
 
 
277 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.76 
 
 
269 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  39.45 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.61 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.61 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 
275 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
268 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 
278 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.52 
 
 
266 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  39.92 
 
 
255 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
278 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 
279 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.13 
 
 
278 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 
280 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.43 
 
 
274 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
277 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.63 
 
 
277 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  38.05 
 
 
280 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.29 
 
 
275 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  40.6 
 
 
267 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
261 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  35.97 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
274 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
267 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
278 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
276 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.61 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.95 
 
 
273 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.93 
 
 
273 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.91 
 
 
274 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.84 
 
 
270 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
272 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.86 
 
 
252 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
560 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
249 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.79 
 
 
263 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
255 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
283 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
256 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
299 aa  92  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
257 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.51 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.5 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.95 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.93 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.04 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.94 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.04 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.1 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  29.22 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>