More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2492 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
290 aa  590  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.84 
 
 
290 aa  377  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  68.42 
 
 
292 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.63 
 
 
295 aa  351  8.999999999999999e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.21 
 
 
292 aa  319  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.77 
 
 
279 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
295 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
292 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 
296 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
305 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
301 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 
302 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  39.53 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.1 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 
297 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  37.33 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
296 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 
300 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.41 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.07 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
321 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  33 
 
 
293 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  32.07 
 
 
280 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
309 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
315 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
314 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
292 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  28.14 
 
 
299 aa  99.8  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.99 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  30.36 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  30.3 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  31.94 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  27.74 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  30.6 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  30.89 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  29.32 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  32.5 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  29.32 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  29.32 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  31.75 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  28.95 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  28.8 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  29.32 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  28.8 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  30.53 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  29.03 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  29.26 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  28.95 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  28.27 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  28.12 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  27.51 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  29.79 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  31.32 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  28.04 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  28.87 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  29.19 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  29.1 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.85 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0398  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  30.22 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  28.65 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  30.59 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>