More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3286 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  61.7 
 
 
292 aa  345  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.43 
 
 
290 aa  339  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.67 
 
 
295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.21 
 
 
290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.64 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.19 
 
 
292 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 
295 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.76 
 
 
305 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.51 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
299 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 
296 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
302 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  36.43 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  36.27 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
300 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  35.67 
 
 
293 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
309 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
315 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
309 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
321 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  30.5 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  32.46 
 
 
313 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
295 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  30.56 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
305 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
303 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  28.12 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  32.29 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  24.32 
 
 
339 aa  79  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  28.27 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.11 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  31 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  29.19 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  34.07 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  33.52 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  30.39 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  26.46 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  33.54 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  30.39 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  31.38 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  26.88 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  30.11 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  27.01 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  26.88 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  27.42 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  30.85 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  31.05 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  26.54 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  30.85 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  30.32 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  30.65 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  34.62 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  30.85 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>