More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3338 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
322 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.87 
 
 
321 aa  531  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  54.15 
 
 
293 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.72 
 
 
327 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  52.03 
 
 
313 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
315 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
302 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.87 
 
 
292 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
301 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
279 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
290 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
300 aa  125  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.69 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
297 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
297 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
309 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
305 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
298 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  30.19 
 
 
297 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
290 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
295 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
295 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
292 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
279 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
282 aa  99.8  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  25.94 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  26.93 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  36.07 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  31.46 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  33.15 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1614  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  28.96 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  30.39 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  32.22 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  25.23 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  30.77 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.91 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  26.35 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1431  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  27 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  31.79 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  27.3 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  21.81 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  25.67 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1602  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  27.87 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  24.85 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  25.08 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.39 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  29.15 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.22 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  25.08 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  25.62 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
328 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.31 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  30.39 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  29.89 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>