More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3760 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.72 
 
 
355 aa  705    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
355 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
355 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.24 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
356 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
337 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  34.78 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  34.78 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  34.97 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  30.95 
 
 
523 aa  82.8  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  34.24 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  34.41 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  32.43 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  32.61 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.08 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  34.78 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  34.24 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0904  hypothetical protein  35.14 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344615  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.13 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  34.24 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.98 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.13 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  34.97 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  33.15 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  33.7 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  32.12 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.87 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.15 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00880027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.82 
 
 
306 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  32.64 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  32.81 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.23 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  35.26 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.33 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  31.72 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  30.51 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  30.51 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.3 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  32.45 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  31.41 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  32.58 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  33.7 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.79 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.52 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  31.52 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.01 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  31.63 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  30.69 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  33.88 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  29.47 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  30.65 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5494  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.26 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.58 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.47 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  28.44 
 
 
688 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  26.11 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  31.28 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.71 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  28.19 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  31.72 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.4 
 
 
355 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  29.57 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.12 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.12 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  28.27 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.37 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  27.32 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  26.06 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  27.84 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  27.84 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.35 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  32.97 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  32.56 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  27.84 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.92 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>