More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2425 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
356 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.74 
 
 
356 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.24 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.24 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.95 
 
 
355 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.89 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
507 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  32.07 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  31.75 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  32.8 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  32.26 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.48 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.35 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00880027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  25.4 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  29.53 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  33.88 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  31.89 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  28.23 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.48 
 
 
330 aa  60.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
519 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  30.98 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  31.18 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
503 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  24.44 
 
 
319 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  28.5 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
325 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.32 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  28.71 
 
 
337 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
323 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  26.32 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0904  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344615  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  28.23 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.86 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.41 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.59 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.6 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.68 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  22.76 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  30.61 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  28.92 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.68 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
314 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  25.48 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.23 
 
 
297 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  29.53 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  27.75 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  28.86 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  25.96 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.76 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  28.92 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.16 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  25.48 
 
 
338 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  28.71 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
271 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  25.96 
 
 
338 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.58 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  27.75 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0540  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.14 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.94 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  28.23 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  28.3 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.95 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  27.52 
 
 
688 aa  56.2  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.04 
 
 
355 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.55 
 
 
348 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  31.45 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  32.22 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.52 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  31.07 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  27.83 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  25.48 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>