More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0482 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.88 
 
 
296 aa  322  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
312 aa  205  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.75 
 
 
302 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
282 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.3 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
279 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
296 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
290 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 
299 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  34.67 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  31.37 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
292 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
279 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
321 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
295 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
302 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
297 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  31.46 
 
 
299 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
327 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
297 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
303 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
292 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.23 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
333 aa  89.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  36.99 
 
 
329 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  31.66 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  27.86 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  27.86 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  37.06 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  36.21 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  37.7 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  28.4 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0351  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  36.47 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  27.53 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  28.21 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  34.32 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  34.18 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  33.15 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  32.84 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  25.84 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  34.02 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.86 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  35 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  27.69 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  37.34 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  35.2 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  37.34 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  32.96 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2992  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.76 
 
 
356 aa  75.5  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.147327  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  35.8 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  30.11 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.62 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>